پس از روی کار آمدن امارت اسلامی در افغانستان، آمریکا ضمن تحریک گرو‌ه‌های مقاومت پنجشیر و برخی مخالفان مناطق دیگر کشور علیه امارت اسلامی، یکی از اصلی‌ترین پروژه‌‌های خود یعنی تشویق و ترغیب شیعیان افغانستان به در تقابل قرار گرفتن آنان با حاکمیت نوپای امارت اسلامی را روی دست گرفت.