منابع محلی در ولایت بادغیس از کمبود کتاب‌های درسی، نبود استادان مسلکی و نامنظم بودن آن‌ها و هم‌چنین مخالفت‌های طالبان با ادامه آموزش دختران بالاتر از صنف 6، به عنوان مشکلات نظام معارف در این ولایت یاد می‌کنند. با وجود این مشکلات، شورای ولایتی بادغیس از برنامه ساخت 253 مکتب جدید از طریق برنامه اقراء در این ولایت خبر می‌دهد.