جامعةالمصطفی در محکومیت کشتار شیعیان بی دفاع کویته پاکستان در عملیات تروریستی دشمنان اسلام بیانیه ای صادرکرد. 
این بیانیه ضمن محکوم نمودن کشتار شیعیان کویته پاکستان، خاطر نشان کرده است: همواره و به ویژه در سال های اخیر، ترور و کشتار مردم مظلوم، یکی از ابزارهای دشمنان برای تفرقه افکنی در امت اسلامی بوده تا به خیال واهی خویش، به اهداف پوشالی شان جامه عمل بپوشانند و مقاصد پلیدشان را عملی سازند. 
این بار و در جنایتی دیگر، دست وهابیان اسلام ستیز و دست پروردگان استکبار جهانی و در رأس آن، امریکا، انگلیس و اسرائیل، به خون شماری از شیعیان بی دفاع کویته پاکستان آلوده شد. در کشتار شیعیان کویته پاکستان، وهابیان و آنان که به نام اسلام، بدترین رفتارها را نشان می دهند، شماری از بی گناهان را به خاک و خون کشیدند تا امریکا و اربابان خونخوار خویش را خشنود سازند. 
در پایان این بیانیه به به اتحاد هر چه بیشتر دولت و ملت پاکستان در برابر فتنه‎ی فتنه انگیزان، تاکید شده و آمده است: دولت و ملت پاکستان با اتحاد هر چه بیشتر در برابر دشمنان از خود واکنش نشان دهند و ضمن ناکام ساختن دشمنان در دست یابی به اهدافشان، نشان دهند که همچنان پیرو تعالیم روح بخش اسلام ناب محمدی(ص) هستند. 
جامعة المصطفی، ضمن محکوم کردن حوادث خونبار اخیر پاکستان، خواستار دستگیری و مجازات عوامل این حادثه و برقراری امنیت کامل در پاکستان است.