شورای هماهنگی هیأت های مذهبی مهاجرین افغانستانی مقیم ایران ضمن محکوم کردن اعدام آیت الله نمر و ۴۶ نفر از یاران او، اقدام دولت آل سعود را احمقانه خواند و عنوان کرد که این دولت بهای سنگینی خواهد پرداخت.
این شورا طی بیانیه ای گفته است که مسیر شیخ نمر همواره از سوی جهان اسلام خصوصا شیعیان عربستان دنبال خواهد شد.
در ادامه بیانیه شورای هماهنگی هیأت های مذهبی مهاجرین افغانستانی آمده است که رژیم آل سعود با این کار نشان داد که پشت پرده جنایات بزرگی در دنیای اسلام همچون نیجریه است و مأموریتش پیاده کردن اهداف نظام سلطه و استکبار و رژیم صهیونیستی است با همین رویکرد اقدامات فجیعی را در دنیا انجام می‌دهد.
در ادامه بیانیه آمده است که رژیم آل‌سعود باید بداند که شهادت آیت الله نمر، این دودمان را برانداز خواهد کرد، قطعا شیعیان عربستان سعودی سکوت نخواهند کرد، ان شاء الله این خون باعث می‌شود رژیم آل یهود بربیفتد.
دیده بان حقوق بشر نیز، روز شنبه اعدام آیت الله شیخ نمر باقر النمر روحانی برجسته عربستانی را محکوم و تاکید کرد: اعدام های گروهی، سبب تیره تر شدن \'پرونده پیشاپیش خدشه دار سعودی\' در زمینه حقوق بشر خواهد شد.
«سارا لیا ویتسون» مدیر حوزه خاورمیانه در سازمان دیده بان حقوق بشر در این باره گفت: جلسه محاکمه النمر \'ناعادلانه\' بود و اعدامش نیز تنها به اختلاف های فرقه ای و ناآرامی ها دامن خواهد زد.
وی افزود: فارغ از جرمی که افراد به آن متهم هستند، اعدام گروهی زندانیان تنها سبب خواهد شد پرونده لکه دار حقوق بشر در عربستان، بیش از پیش تیره شود.
ویتسون افزود: بازگشت ثبات به شرق عربستان، منوط به توقف تبعیض های نظام مند علیه شهروندان شیعه است و این مشکل، با اعدام برطرف نخواهد شد.